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日本的地方博物馆和主题馆种类丰富，既有历史文化类，也有自然科学和特色产业类，每个地区都有自己独特的展览特色。以下按地区整理：
北海道・东北地区
| 博物馆/主题馆 | 地点 | 特色展览 |
|---|---|---|
| 北海道博物馆 | 札幌 | 北海道自然环境、原住民阿伊努文化、生态展示 |
| 札幌市青少年科学馆 | 札幌 | 天文、物理互动体验展 |
| 弘前市立博物馆 | 弘前（青森） | 弘前城历史、津轻地区民俗展览 |
| 仙台市博物馆 | 仙台 | 伊达政宗相关历史文物、东日本历史文化展 |
关东地区
| 博物馆/主题馆 | 地点 | 特色展览 |
|---|---|---|
| 东京国立博物馆 | 上野 | 日本和东亚历史文物、古代艺术品、国宝展 |
| 江户东京博物馆 | 东京 | 江户时代历史、城镇生活、复原模型 |
| 横滨开港资料馆 | 横滨 | 开港历史、西洋文化与港口发展 |
| 群马县富冈制丝厂博物馆 | 富冈 | 日本近代工业遗产，蚕丝和制丝机器展示 |
中部地区
| 博物馆/主题馆 | 地点 | 特色展览 |
|---|---|---|
| 名古屋市科学馆 | 名古屋 | 天文、化学互动展，地球和宇宙科学 |
| 丰田博物馆 | 爱知 | 汽车发展史、工业技术展 |
| 金泽21世纪美术馆 | 金泽 | 现代艺术、互动装置展 |
| 松本市立博物馆 | 松本（长野） | 松本城历史、民俗文化、传统工艺 |
关西地区
| 博物馆/主题馆 | 地点 | 特色展览 |
|---|---|---|
| 京都国立博物馆 | 京都 | 佛教艺术、书画、传统工艺展 |
| 奈良国立博物馆 | 奈良 | 佛教美术、古文物、正仓院文物复制展 |
| 大阪市立科学馆 | 大阪 | 科学互动展、天文观测 |
| 神户海洋博物馆 | 神户 | 港口发展、船舶与海洋科技展示 |
九州地区
| 博物馆/主题馆 | 地点 | 特色展览 |
|---|---|---|
| 长崎原爆资料馆 | 长崎 | 原子弹历史、和平教育展 |
| 别府地狱温泉博物馆 | 别府 | 地热与温泉科学、温泉历史展 |
| 福冈亚洲美术馆 | 福冈 | 亚洲艺术作品、现代与传统结合展 |
冲绳地区
| 博物馆/主题馆 | 地点 | 特色展览 |
|---|---|---|
| 冲绳县立博物馆 | 那霸 | 琉球王国历史、民俗、自然环境展 |
| 琉球玻璃村 | 那霸周边 | 玻璃工艺制作展示、互动体验展 |
| 玉泉洞王国村 | 南部 | 沖繩自然地质与民俗展示 |
特色总结
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历史与民俗：各地博物馆展示地方历史、城镇文化、传统工艺，如京都国立博物馆、松本市立博物馆。
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现代科技与互动：科学馆、汽车博物馆、天文馆互动性强，适合亲子游，如名古屋市科学馆、札幌市青少年科学馆。
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产业与主题特色：地方特产、产业相关主题馆，如丰田博物馆、富冈制丝厂博物馆。
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和平与自然教育：原爆资料馆、地热温泉博物馆、冲绳博物馆等强调教育意义。
